*Selamat datang semua di Kimia Komputasi Ummu Hanifah!*
* Semoga ilmu yang ada disini bermanfaat bagi kita semua ya! *
* Semoga ilmu yang ada disini bermanfaat bagi kita semua ya! *
Geometri optimasi dengan HyperChem
Dokumen ini hanya menjelaskan salah satu dari banyak cara di mana Hyperchem mampu mengoptimalkan geometri molekul. Para keterampilan dasar yang dijelaskan dalam Dasar Keterampilan dalam HyperChem akan digunakan. Jika Anda tidak akrab dengan itu, kami sarankan Anda membaca terlebih dahulu.
CATATAN: Jangan hanya menggunakan deskripsi ini untuk sederhana molekul organik (alkana, alkena, alkuna, dan aromatik dari ukuran yang layak, misalnya lupa tentang fullerene!) Batas praktis adalah: 10 non-hidrogen dan 18 hidrogen, Total kurang dari 26 atom.
JANGAN menggunakan deskripsi ini untuk:
Optimasi geometri Metode yang digunakan di sini adalah default metode yang diberikan di HyperChem, MM +. Hal ini sangat mudah untuk mengkonfigurasi dan hasilnya tidak terlalu buruk.
Pertama-tama Anda perlu untuk membangun sebuah molekul dalam HyperChem jendela. Anda mungkin impor molekul dengan pergi ke File (Terbuka) submenu. Tugas ini dijelaskan dalam panduan "Dasar Keterampilan dalam HyperChem" yang harus Anda baca sebelum menggunakan panduan ini. Sekarang Anda dapat mulai menggunakan optimasi geometri. Oleh karena itu Anda memilih menu "Setup" di baris atas jendela HyperChem oleh mengkliknya. Pada daftar Anda kemudian pilih "Molecular Mekanika ". Pada jendela" Angkatan Mekanika Molekuler Lapangan "yang muncul kemudian Anda pilih" + MM ". Lalu Anda klik pada tombol "Options .." dan pastikan bahwa di MM jendela + Opsi pengaturan berikut muncul:
Menentukan parameter geometrik
Anda dapat menggunakan mouse untuk mendapatkan panjang ikatan dan sudut ikatan molekul pada layar. Untuk melakukan itu, Anda klik dengan kiri tombol mouse pada atom awal dan tahan tombol mouse ditekan. Kemudian Anda memindahkan mouse ke atom akhir dalam molekul, kursor mouse menunjukkan garis putih mulai dari atom pertama dan atom akhir dan kemudian Anda melepas mouse tombol. Atom dan obligasi yang pergi dari pertama sampai terakhir atom sekarang dipilih dalam hijau dan parameter geometris yang ditampilkan pada baris bawah dari jendela HyperChem. Anda dapat juga menghitung jarak antara dua atom yang tidak terikat bersama. Pertama Anda harus memastikan bahwa dalam menu "Smemilih "baris" Multiple Seleksi "aktif. Jika tidak ada tanda di sebelah kiri baris ini maka cukup klik di atasnya. Untuk memilih dua atom hanya klik dengan tombol kiri mouse sekali pada setiap atom, mereka ada perubahan penampilan untuk lingkaran hijau dan jarak melalui ruang adalah ditampilkan di baris bawah layar.
Hidrogen Obligasi
HyperChem tahu tentang ikatan hidrogen. Tapi, sangat sulit untuk beruntung untuk mendapatkan ikatan hidrogen ditampilkan! Masalahnya adalah, "HyperChem menciptakan ikatan hidrogen jika jarak antara hidrogen donor dan akseptor atom kurang dari 3,2 Å dan sudut yang dibuat oleh ikatan kovalen dengan atom donor dan akseptor lebih besar dari 150 derajat ", menurut referensi manual. Satu dapat mengubah kriteria tersebut dalam sebuah file pengaturan untuk Hyperchem, tapi saya pikir kita harus memutuskan apakah perubahan ini benar-benar diperlukan.
Nama saya Ummu Hanifah, seorang mahasiswa Kimia yang Unique!
~ Universitas ~UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
~ Jurusan ~Chemistry
~ Address Umu ~Jakarta
* TAG ARTIKEL KOMPUTASI...^_^ *
西野カナ-たとえ どんなに…