[ Selamat datang di Kimia Cemerlang ] :)

<body><script type="text/javascript"> function setAttributeOnload(object, attribute, val) { if(window.addEventListener) { window.addEventListener('load', function(){ object[attribute] = val; }, false); } else { window.attachEvent('onload', function(){ object[attribute] = val; }); } } </script> <div id="navbar-iframe-container"></div> <script type="text/javascript" src="https://apis.google.com/js/platform.js"></script> <script type="text/javascript"> gapi.load("gapi.iframes:gapi.iframes.style.bubble", function() { if (gapi.iframes && gapi.iframes.getContext) { gapi.iframes.getContext().openChild({ url: 'https://www.blogger.com/navbar.g?targetBlogID\x3d2958737776999423659\x26blogName\x3dKIMIA+CEMERLANG\x26publishMode\x3dPUBLISH_MODE_BLOGSPOT\x26navbarType\x3dBLUE\x26layoutType\x3dCLASSIC\x26searchRoot\x3dhttps://ummuhanifahkimia3.blogspot.com/search\x26blogLocale\x3din\x26v\x3d2\x26homepageUrl\x3dhttp://ummuhanifahkimia3.blogspot.com/\x26vt\x3d-8669104799879042782', where: document.getElementById("navbar-iframe-container"), id: "navbar-iframe", messageHandlersFilter: gapi.iframes.CROSS_ORIGIN_IFRAMES_FILTER, messageHandlers: { 'blogger-ping': function() {} } }); } }); </script>

Kimia Cemerlang!

*Selamat datang semua di Kimia Komputasi Ummu Hanifah!*

* Semoga ilmu yang ada disini bermanfaat bagi kita semua ya! *

Senin, 02 Januari 2012

Molekuler Modeling dalam ChemPup>

Pemodelan molekul adalah bidang terus berkembang kimia teoritis dan secara umum harus diserahkan kepada Pro! Namun, ChemPup tidak memiliki kemampuan untuk melakukan beberapa pemodelan molekul dasar yang berfungsi sebagai sumber yang bagus untuk siswa kimia dari semua tingkatan.

Untuk pemula, model sederhana dapat dibangun, dilihat dan diminimalkan mudah dengan molekul pembangun Avogadro. Siswa akan dengan mudah dapat melihat interaksi sterik menggunakan built-in kekuatan-bidang pengecil (Ghemical, MMFF, dll) dengan algoritma "curam yang layak".

Untuk pengguna yang lebih maju, Avogadro dan JMol baik mudah menghasilkan file masukan Gaussian (. Gjf,. Com) yang mungkin sangat berguna bagi mereka yang memiliki akses ke Suite Gaussian Program.

Pengguna terdaftar dari ChemToolBox.com juga memiliki akses ke repositori download yang saat ini memiliki puluhan sulit untuk mendapatkan koordinat fullerene (pdb format.) Dan siap untuk melihat (xyz format.) Cyclacene. File PDB dapat dikonversi ke file xyz menggunakan langkah-langkah berikut.:

1. download file. pdf, buka dengan "text editor" dan masukkan spasi setelah setiap simbol atom (yaitu C, H, N, O, S, dll)

2. menyalin isi untuk A1 di spreadsheet (penggabungan pembatas: tab, spasi)

3. menghilangkan baris 1 dan 2 serta kolom D, E, F

4. copy kolom C, D, E, F ke editor teks

5. masukkan jumlah total atom di bagian atas diikuti dengan baris kosong dan koordinat dan save as nama file.xyz

6. buka file dengan JMol atau Avogadro

Silakan mempertimbangkan meng-upload file xyz dikonversi kembali. Ke repositori ChemToolBox.com bagi orang lain untuk digunakan!

reference by"http://synergeneration.com/ryanelia/2009/10/molecular-modeling-in-chempup/

# posted by Ummu Hanifah at 22.52

西野カナ-たとえどんなに…